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考生将本人准考证、身份证以及全部单科合格证书交当地自考办初审，经初审合格后发给《毕业生登记表》。
《毕业生登记表》由考生本人填写，所在单位（非在职人员由街道办事处或乡人民政府）签署意见后，于规定日期送交当地自学考试办公室报所在市自学考试工作委员会和省考委审核。
考生填写《毕业生登记表》不得隐瞒和造假，不得擅自涂改，违者将予以严肃处理，直至取消毕业资格；审核合格者，由省、自治区、直辖市考委颁发相应的毕业证书，主考学校在毕业证书上副署。
毕业生的有关档案材料由省自学考试办公室送毕业生所在单位组织、人事或劳动部门存入本人档案。
毕业申请
一、自学考试采用施考分科、学分累计的方式逐步完成学业。按照专业考试计划的要求，分课程进行考试，课程考试合格者按规定计算学分。不及格者可参加下一次该课程的考试。考完专业考试计划规定的全部课程并取得合格成绩，完成毕业论文或其他教学实践任务，思想品德鉴定合格者准予毕业取得相应毕业证书。
二、自学考试的毕业申请时间上半年为6月15~20日，下半年为12月15~20日。申请上半年毕业的考生，必须在5月1日前办理合并准考证号、转考、免考、考籍数据更正手续；申请下半年毕业的考生，必须在11月1日前办理合并准考证号、转考、免考、考籍数据更正手续。逾期办理者，不能申请本次毕业。
三、办理本科毕业申请的考生，请提前办理前学历的学历鉴定，以便在申请毕业时同时提交。申请上半年本科毕业的应届专科毕业生，可延迟至8月5日前提交学历鉴定。按规定可延迟提交学历鉴定的，由考生自行复印鉴定证明，并在复印件上注明准考证号、所属地市、毕业专业等信息，将复印件寄往省考办。
四、申请办理行政管理学（独立本科段）专业毕业的考生，需提供其专科成绩单。
五、申请办理护理学（专科、独立本科段）、中医护理学（专科）、社区护理学（专科、独立本科段）、药学（独立本科段）专业毕业的考生，需按专业要求提供资格证书。
六、高等教育自学考试的毕业时间为每年的六月和十二月。
七、考生的毕业生考籍档案是考生评定职称、工资调整、工作变动的重要依据。考生领取毕业生考籍档案后，应及时交所在单位人事部门管理，工作单位不固定的考生可将毕业生考籍档案交人才交流中心代管。
八、按照教育部有关规定，自学考试毕业证遗失或损毁不再补办。若考生需要，可申请开具《毕业证明书》（此证明只开具一次，请考生妥善保管）。申请办理《毕业证明书》的流程及要求为：①考生须在省级日报或省级教育报刊登毕业证遗失声明；②考生持刊登毕业证遗失声明的报纸、本人身份证、毕业生审批登记表复印件以及个人申请到原发证地、州、市自考办查阅毕业生花名册，由当地自考办核实后开具毕业证明；③考生本人持地州自考办开具的证明及上述材料到自治区自考办办理《毕业证明书》。
九、高等教育自学考试毕业证查询和学历认证，有两种情况： ① 2001年12月（含）后毕业的毕业生可通过 "中国高等教育学生信息网 (学信网) " 在线查询认证。 ② 2001年6月（含）前毕业的毕业生由需要对考生的自考毕业证书进行认证的用人单位或招生院校向中国高等教育学生信息网或发放毕业证书的省自考办出具《学历认证委托函》以及考生的毕业证书、身份证原件及其复印件，办理相关查询认证手续。